Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO2P25791 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO2P25791 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO2P25791 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO2P25791 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO2P25791 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO2P25791 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO2P25791 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO2P25791 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO2P25791 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO2P25791 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO2P25791 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO2P25791 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO2P25791 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO2P25791 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO2P25791 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMO2P25791 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO2P25791 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO2P25791 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO2P25791 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO2P25791 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO2P25791 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO2P25791 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO2P25791 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO2P25791 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO2P25791 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms