Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHGAP10645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CHGAP10645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHGAP10645 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHGAP10645 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHGAP10645 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHGAP10645 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHGAP10645 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHGAP10645 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHGAP10645 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHGAP10645 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHGAP10645 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHGAP10645 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHGAP10645 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHGAP10645 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CHGAP10645 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHGAP10645 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CHGAP10645 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHGAP10645 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHGAP10645 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHGAP10645 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHGAP10645 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHGAP10645 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHGAP10645 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHGAP10645 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHGAP10645 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHGAP10645 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHGAP10645 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHGAP10645 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHGAP10645 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHGAP10645 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHGAP10645 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms