Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLI4P10075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLI4P10075 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLI4P10075 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLI4P10075 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI4P10075 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI4P10075 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI4P10075 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI4P10075 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLI4P10075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GLI4P10075 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLI4P10075 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI4P10075 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI4P10075 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI4P10075 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms