Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UQCRFS1P1P0C7P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UQCRFS1P1P0C7P4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UQCRFS1P1P0C7P4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms