Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TNP1P09430 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TNP1P09430 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TNP1P09430 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms