Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNA1P01562 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA1P01562 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms