Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNE2O96020 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNE2O96020 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNE2O96020 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms