Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP3BO95985 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3BO95985 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms