Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf47O95873 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms