Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDF1O60869 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDF1O60869 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDF1O60869 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDF1O60869 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDF1O60869 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDF1O60869 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDF1O60869 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDF1O60869 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDF1O60869 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDF1O60869 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDF1O60869 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDF1O60869 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDF1O60869 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDF1O60869 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDF1O60869 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDF1O60869 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms