Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E5RI56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E5RI56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E5RI56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E5RI56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E5RI56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E5RI56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E5RI56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E5RI56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E5RI56 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E5RI56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E5RI56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
E5RI56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
E5RI56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E5RI56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E5RI56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E5RI56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E5RI56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E5RI56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E5RI56 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E5RI56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E5RI56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E5RI56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E5RI56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E5RI56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms