Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms