Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms