Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF25A6NGN4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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