Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L9A6NEM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L9A6NEM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms