Protein–RNA interactions for Protein: A6NDS4

TBC1D3B, TBC1 domain family member 3B, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3BA6NDS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBC1D3BA6NDS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBC1D3BA6NDS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBC1D3BA6NDS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms