Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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