Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
V9GYQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
V9GYQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
V9GYQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
V9GYQ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
V9GYQ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
V9GYQ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
V9GYQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
V9GYQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
V9GYQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
V9GYQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
V9GYQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
V9GYQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
V9GYQ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
V9GYQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
V9GYQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms