Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYH0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYH0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYH0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYH0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYH0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYH0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYH0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYH0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYH0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYH0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYH0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYH0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYH0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
V9GYH0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
V9GYH0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
V9GYH0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
V9GYH0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYH0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYH0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYH0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms