Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC23IPQ9Y6Y8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms