Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGEF1Q9Y6D6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms