Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms