Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms