Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FCF1Q9Y324 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FCF1Q9Y324 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCF1Q9Y324 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms