Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS3Q9UPU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORCS3Q9UPU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms