Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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