Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPG2Q9UBF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPG2Q9UBF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms