Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD8Q9NX08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COMMD8Q9NX08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD8Q9NX08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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