Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFA1Q9NP55 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms