Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPNS1Q9H2V7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS1Q9H2V7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPNS1Q9H2V7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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