Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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