Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PITPNM3Q9BZ71 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNM3Q9BZ71 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms