Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms