Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF649Q9BS31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF649Q9BS31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF649Q9BS31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms