Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms