Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RETNLBQ9BQ08 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms