Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM3Q96PE6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM3Q96PE6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms