Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC43Q96MW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC43Q96MW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC43Q96MW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms