Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRRFQ96E11 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRRFQ96E11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRRFQ96E11 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms