Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC47Q96A33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms