Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01555Q8NAE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01555Q8NAE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms