Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTL3Q8N8U3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTL3Q8N8U3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms