Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS6Q86YV9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS6Q86YV9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS6Q86YV9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms