Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP30Q70CQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms