Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK4Q6SA08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms