Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC62Q6P9F0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms