Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHAF4Q5VUM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms