Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms