Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP5B1Q2VPB7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP5B1Q2VPB7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms