Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA9Q16790 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA9Q16790 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA9Q16790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA9Q16790 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA9Q16790 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA9Q16790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CA9Q16790 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CA9Q16790 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA9Q16790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA9Q16790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA9Q16790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CA9Q16790 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CA9Q16790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA9Q16790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA9Q16790 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CA9Q16790 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CA9Q16790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA9Q16790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA9Q16790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA9Q16790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA9Q16790 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA9Q16790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA9Q16790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA9Q16790 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA9Q16790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA9Q16790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms